Chính phủ vừa ban hành Nghị định số 373/2025/NĐ-CP ngày 31/12/2025, sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định số 126/2020/NĐ-CP quy định chi tiết một số điều của Luật Quản lý thuế. Nghị định mới có hiệu lực thi hành từ ngày 14/2/2026, trong đó bổ sung quy định quan trọng liên quan đến xử phạt chậm nộp hồ sơ khai thuế khi người nộp thuế phải điều chỉnh kỳ tính thuế.

Một trong những nội dung đáng chú ý của Nghị định là việc bổ sung khoản 3 Điều 9 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP, hướng dẫn cụ thể cách xử lý đối với trường hợp người nộp thuế đã thực hiện khai thuế theo quý nhưng sau đó xác định không đủ điều kiện khai thuế theo quý theo quy định.

Ảnh minh họa

Theo đó, nếu người nộp thuế tự phát hiện không đủ điều kiện khai thuế theo quý, người nộp thuế phải thực hiện khai thuế theo tháng kể từ tháng đầu của quý tiếp theo, đồng thời nộp lại hồ sơ khai thuế theo tháng của các quý trước và thực hiện tính tiền chậm nộp theo quy định. Trường hợp cơ quan thuế phát hiện người nộp thuế không đủ điều kiện khai thuế theo quý thì cơ quan thuế ban hành văn bản yêu cầu người nộp thuế chuyển sang khai thuế theo tháng kể từ tháng đầu của quý tiếp theo và nộp lại hồ sơ khai thuế theo tháng của các quý trước, trừ trường hợp việc phát hiện được thực hiện thông qua kiểm tra tại trụ sở người nộp thuế. Khi đó, người nộp thuế có trách nhiệm thực hiện việc khai thuế và nộp lại hồ sơ theo yêu cầu của cơ quan thuế.

Đáng chú ý, Nghị định 373/2025/NĐ-CP quy định người nộp thuế không bị xử phạt vi phạm hành chính về chậm nộp hồ sơ khai thuế đối với các hồ sơ khai thuế của những kỳ tính thuế phải nộp lại do thay đổi kỳ tính thuế. Các hồ sơ khai thuế theo tháng đã nộp lại được xác định là hồ sơ khai thuế thay thế cho hồ sơ khai thuế theo quý đã nộp trước đó. Quy định này khắc phục khoảng trống pháp lý trước đây, khi Nghị định số 126/2020/NĐ-CP chưa có hướng dẫn cụ thể về việc miễn xử phạt trong các trường hợp phải nộp lại hồ sơ do sai kỳ tính thuế, qua đó góp phần giảm rủi ro xử phạt cho người nộp thuế.

Bên cạnh đó, Nghị định số 373/2025/NĐ-CP cũng sửa đổi quy định về địa điểm nộp hồ sơ quyết toán thuế thu nhập cá nhân đối với cá nhân cư trú có thu nhập từ tiền lương, tiền công tại hai nơi trở lên và thuộc diện tổ chức chi trả khấu trừ tại nguồn. Theo quy định mới, cá nhân trong trường hợp này thực hiện nộp hồ sơ quyết toán thuế tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp tổ chức trả thu nhập lớn nhất trong năm. Trường hợp có từ hai nguồn thu nhập lớn nhất trở lên với mức thu nhập bằng nhau, người nộp thuế được lựa chọn nộp hồ sơ tại một trong các cơ quan thuế quản lý trực tiếp các tổ chức chi trả đó.

Trong trường hợp cá nhân nộp hồ sơ quyết toán thuế không đúng cơ quan thuế theo quy định, cơ quan thuế đã tiếp nhận hồ sơ có trách nhiệm căn cứ dữ liệu trên hệ thống quản lý thuế để hỗ trợ chuyển hồ sơ đến đúng cơ quan thuế có thẩm quyền, bảo đảm quyền lợi cho người nộp thuế và không làm gián đoạn quá trình quyết toán. Quy định này thay thế cách xác định nơi nộp hồ sơ trước đây vốn phụ thuộc vào nhiều tiêu chí khác nhau, qua đó tạo thuận lợi cho người nộp thuế, bảo đảm công bằng nguồn thu ngân sách giữa các địa phương và nâng cao hiệu quả quản lý thuế.

Ngoài ra, Nghị định 373/2025/NĐ-CP cũng bổ sung quy định về thời hạn nộp khoản tiền người sử dụng đất phải nộp bổ sung đối với thời gian chưa tính tiền sử dụng đất, tiền thuê đất vào ngân sách nhà nước. Trên cơ sở sửa đổi, bổ sung khoản 3 và khoản 4 Điều 18 Nghị định số 126/2020/NĐ-CP, Nghị định đã quy định rõ thời điểm cơ quan thuế ban hành thông báo và thời hạn người sử dụng đất, người thuê đất phải thực hiện nghĩa vụ tài chính, bao gồm cả các trường hợp nộp tiền thuê đất hằng năm, nộp tiền thuê đất một lần cho cả thời gian thuê và xác định lại nghĩa vụ tài chính về tiền sử dụng đất.

Việc bổ sung các quy định nêu trên được đánh giá là cần thiết nhằm khắc phục khoảng trống pháp lý, bảo đảm thống nhất trong tổ chức thực hiện pháp luật về thuế, đồng thời tăng tính minh bạch, rõ ràng trong xác định nghĩa vụ tài chính của người nộp thuế và người sử dụng đất.

Nghị định số 373/2025/NĐ-CP chính thức có hiệu lực từ ngày 14/02/2026